モバイルSuicaとd払いアプリの連携を解除する方法を教えてください。

d払いアプリのSuica設定メニューから連携を解除できます。

ただし、d払いアプリとモバイルSuicaの連携を解除しても、モバイルSuicaは端末から削除されません。
Suicaを退会（削除）したい場合は、モバイルSuicaアプリより退会のお手続きを行ってください。