dポイントを利用して決済したところ、ご利用履歴に決済の履歴とdポイントの履歴が両方とも表示されていました。 二重で決済されているのでしょうか？

二重決済にはなっておりません。dポイントを利用して決済した場合、決済のご利用履歴、およびdポイントのご利用履歴両方に決済額が表示されますが、dポイント利用分の決済額のみ差し引かれております。